χ2分布

# -*- coding: UTF-8 -*-
from math import *
import numpy as np

################################################
# 標準正規分布N(0,1)の計算(P(X = x), P(X < x))
#      w : P(X = x)
#      return : P(X < x)
################################################

def normal(x, w) :
			# 確率密度関数(定義式)
	w[0] = exp(-0.5 * x * x) / sqrt(2.0*pi)
			# 確率分布関数(近似式を使用)
	y = 0.70710678118654 * abs(x)
	z = 1.0 + y * (0.0705230784 + y * (0.0422820123 + y * (0.0092705272 + y * (0.0001520143 + y * (0.0002765672 + y * 0.0000430638)))))
	P = 1.0 - z ** (-16.0)

	if x < 0.0 :
		P = 0.5 - 0.5 * P
	else :
		P = 0.5 + 0.5 * P

	return P

##########################################
# χ2乗分布の計算(P(X = ch), P(X < ch))
#      dd : P(X = ch)
#      df : 自由度
#      return : P(X < ch)
##########################################

def chi(ch, dd, df) :


	if ch < 1.0e-10 :
		ch = 1.0e-10

	pis = sqrt(pi)
	chs = sqrt(ch)
	x   = 0.5 * ch
	y   = np.empty(1, np.float)

	if df%2 != 0 :
		u  = sqrt(x) * exp(-x) / pis
		pp = 2.0 * (normal(chs, y) - 0.5)
		ia = 1

	else :
		u  = x * exp(-x)
		pp = 1.0 - exp(-x)
		ia = 2

	if ia != df :
		for i1 in range(ia, df-1, 2) :
			pp -= 2.0 * u / i1
			u  *= (ch / i1)

	dd[0] = u / ch

	return pp

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# 二分法による非線形方程式(f(x)=0)の解
#      fn : f(x)を計算する関数名
#      x1,x2 : 初期値
#      eps1 : 終了条件1(|x(k+1)-x(k)|<eps1)
#      eps2 : 終了条件2(|f(x(k))|<eps2)
#      max : 最大試行回数
#      ind : 実際の試行回数
#            (負の時は解を得ることができなかった)
#      return : 解
#      coded by Y.Suganuma
############################################

def bisection(fn, x1, x2, eps1, eps2, max, ind) :

	x0 = 0.0
	f1 = fn(x1)
	f2 = fn(x2)

	if f1*f2 > 0.0 :
		ind[0] = -1

	else :
		ind[0] = 0
		if f1*f2 == 0.0 :
			if f1 == 0.0 :
				x0 = x1
			else :
				x0 = x2
		else :
			sw = 0
			while sw == 0 and ind[0] >= 0 :
				sw      = 1
				ind[0] += 1
				x0     = 0.5 * (x1 + x2)
				f0     = fn(x0)

				if abs(f0) > eps2 :
					if ind[0] <= max :
						if abs(x1-x2) > eps1 and abs(x1-x2) > eps1*abs(x2) :
							sw = 0
							if f0*f1 < 0.0 :
								x2 = x0
								f2 = f0
							else :
								x1 = x0
								f1 = f0
					else :
						ind[0] = -1

	return x0

############################################
# Newton法による非線形方程式(f(x)=0)の解
#      fn : f(x)を計算する関数名
#      dfn : f(x)の微分を計算する関数名
#      x0 : 初期値
#      eps1 : 終了条件1(|x(k+1)-x(k)|<eps1)
#      eps2 : 終了条件2(|f(x(k))|<eps2)
#      max : 最大試行回数
#      ind : 実際の試行回数
#            (負の時は解を得ることができなかった)
#      return : 解
#      coded by Y.Suganuma
############################################

def newton(fn, dfn, x0, eps1, eps2, max, ind) :

	x1     = x0
	x      = x1
	ind[0] = 0
	sw     = 0

	while sw == 0 and ind[0] >= 0 :

		sw      = 1
		ind[0] += 1
		g       = fn(x1)

		if abs(g) > eps2 :
			if ind[0] <= max :
				dg = dfn(x1)
				if abs(dg) > eps2 :
					x = x1 - g / dg
					if abs(x-x1) > eps1 and abs(x-x1) > eps1*abs(x) :
						x1 = x
						sw = 0
				else :
					ind[0] = -1
			else :
				ind[0] = -1

	return x

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# -*- coding: UTF-8 -*-
import numpy as np
import sys
from math import *
from function import chi, normal, bisection, newton

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# χ2分布の計算
#      coded by Y.Suganuma
############################

##########################################
# 1.0 - p - P(X>x)(関数値, 標準正規分布)
##########################################
def normal_f(x) :
	y = np.empty(1, np.float)
	return 1.0 - p - normal(x, y)

################################################################
# 標準正規分布N(0,1)のp%値(P(X > u) = 0.01p)(二分法を使用)
#      ind : >= 0 : normal(収束回数)
#            = -1 : 収束しなかった
################################################################
def p_normal(ind) :
	u = bisection(normal_f, -7.0, 7.0, 1.0e-6, 1.0e-10, 100, ind)
	return u

##########################################
# 1.0 - p - P(X > x)(関数値, χ2乗分布)
##########################################
def chi_f(x) :
	y = np.empty(1, np.float)
	return (chi(x, y, dof) - 1.0 + p)

####################################
# P(X = x)(関数の微分, χ2乗分布)
####################################
def chi_df(x) :
	y = np.empty(1, np.float)
	z = chi(x, y, dof)
	return y[0]

##########################################
# χ2乗分布のp%値(P(X > u) = 0.01p)
#      ind : >=0 : normal(収束回数)
#            =-1 : 収束しなかった
##########################################
def p_chi(ind) :
	xx = 0.0
			# 自由度=1(正規分布を使用)
	if dof == 1 :
		global p   # この宣言がないとエラー
		po  = p
		p  *= 0.5
		x   = p_normal(ind)
		xx  = x * x
		p   = po

	else :
			# 自由度=2
		if dof == 2 :
			xx = -2.0 * log(p)
			# 自由度>2
		else :

			x = p_normal(ind)   # 初期値計算のため

			if ind[0] >= 0 :

				w  = 2.0 / (9.0 * dof)
				x  = 1.0 - w + x * sqrt(w)
				x0 = (x ** 3.0) * dof   # ニュートン法の初期値
				xx = newton(chi_f, chi_df, x0, 1.0e-6, 1.0e-10, 100, ind)

	return xx

			# 密度関数と分布関数の値
s   = input("自由度は? ")
dof = int(s)
print("目的とする結果は? ")
print("     =0 : 確率の計算( P(X = x) 及び P(X < x) の値)")
s  = input("     =1 : p%値( P(X > u) = 0.01p となるuの値) ")
sw = int(s)
z  = np.empty(1, np.float)

if sw == 0 :
	s  = input("グラフ出力?(=1: yes,  =0: no) ")
	sw = int(s)
	if sw == 0 :
			# 密度関数と分布関数の値
		s  = input("   データは? ")
		x  = float(s)
		y  = chi(x, z, dof)
		print("P(X = " + str(x) + ") = " + str(z[0]) + ",  P( X < " + str(x) + ") = " + str(y) + "(自由度 = " + str(dof) + ")")
			# グラフ出力
	else :
		file1 = input("   密度関数のファイル名は? ")
		file2 = input("   分布関数のファイル名は? ")
		s     = input("   データの下限は? ")
		x1    = float(s)
		s     = input("   データの上限は? ")
		x2    = float(s)
		s     = input("   刻み幅は? ")
		h     = float(s)
		out1  = open(file1, "w")
		out2  = open(file2, "w")
		x     = x1
		while x < x2+0.5*h :
			y = chi(x, z, dof)
			out1.write(str(x) + " " + str(z[0]) + "\n")
			out2.write(str(x) + " " + str(y) + "\n")
			x += h
		out1.close()
		out2.close()
			# %値
else :
	s = input("%の値は? ")
	x = float(s)
	p = 0.01 * x
	if p < 1.0e-7 :
		print(str(x) + "%値 = ∞ (自由度 = " + str(dof) + ")")
	elif (1.0-p)< 1.0e-7 :
		print(str(x) + "%値 = 0 (自由度 = " + str(dof) + ")")
	else :
		ind = np.empty(1, np.int)
		y   = p_chi(ind)
		print(str(x) + "%値 = " + str(y) + "  収束 " + str(ind[0]) + " (自由度 = " + str(dof) + ")")