<?php /**************************************/ /* 分散分析(一元配置法と二元配置法) */ /* coded by Y.Suganuma */ /**************************************/ $Np = array(1, 1); $name = array(2); $p = 0.0; $dof1 = 1; $dof2 = 1; fscanf(STDIN, "%d %d %d", $method, $N, $a); if ($method == 1 || $method == 2) { for ($i1 = 0; $i1 < $method; $i1++) fscanf(STDIN, "%s %d", $name[$i1], $Np[$i1]); $x = array($Np[0]); for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { $x[$i1] = array($Np[1]); for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) $x[$i1][$i2] = array($N); } for ($i1 = 0; $i1 < $Np[1]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $N; $i2++) { $str = trim(fgets(STDIN)); $x[0][$i1][$i2] = floatval(strtok($str, " ")); for ($i3 = 1; $i3 < $Np[0]; $i3++) $x[$i3][$i1][$i2] = floatval(strtok(" ")); } } aov($method, $Np, $N, $name, $a, $x); } else printf("一元配置法,または,二元配置法だけです!\n"); /**************************************/ /* 分散分析(一元配置法と二元配置法) */ /* method : 1 or 2 */ /* Np[0] : 因子1の水準数 */ /* [1] : 因子2の水準数 */ /* N : データ数 */ /* name[0] : 因子1の名前 */ /* [1] : 因子2の名前 */ /* a : a %値 */ /* x : データ */ /* coded by Y.Suganuma */ /**************************************/ function aov($method, $Np, $N, $name, $a, $x) { global $p, $dof1, $dof2; // 一元配置法 if ($method == 1) { $xi = array($Np[0]); for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { $xi[$i1] = 0.0; for ($i2 = 0; $i2 < $N; $i2++) $xi[$i1] += $x[$i1][0][$i2]; $xi[$i1] /= $N; } $xa = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $N; $i2++) $xa += $x[$i1][0][$i2]; } $xa /= ($Np[0] * $N); $SP = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) $SP += ($xi[$i1] - $xa) * ($xi[$i1] - $xa); $SP *= $N; $SE = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $N; $i2++) $SE += ($x[$i1][0][$i2] - $xi[$i1]) * ($x[$i1][0][$i2] - $xi[$i1]); } $VP = $SP / ($Np[0] - 1); $VE = $SE / ($Np[0] * ($N - 1)); $FP = $VP / $VE; $p = 0.01 * $a; $dof2 = $Np[0] * ($N - 1); printf("全変動: 平方和 %.2f 自由度 %d\n", $SP+$SE, $Np[0]*$N-1); $dof1 = $Np[0] - 1; printf("%sの水準間: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f F %.2f %d%値 %.2f\n", $name[0], $SP, $Np[0]-1, $VP, $FP, $a, p_f($sw)); printf("水準内: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f\n", $SE, $Np[0]*($N-1), $VE); } // 二元配置法 else { $xi = array($Np[0]); for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { $xi[$i1] = 0.0; for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) { for ($i3 = 0; $i3 < $N; $i3++) $xi[$i1] += $x[$i1][$i2][$i3]; } $xi[$i1] /= ($Np[1] * $N); } $xj = array($Np[1]); for ($i1 = 0; $i1 < $Np[1]; $i1++) { $xj[$i1] = 0.0; for ($i2 = 0; $i2 < $Np[0]; $i2++) { for ($i3 = 0; $i3 < $N; $i3++) $xj[$i1] += $x[$i2][$i1][$i3]; } $xj[$i1] /= ($Np[0] * $N); } $xij = array($Np[0]); for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { $xij[$i1] = array($Np[1]); for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) { $xij[$i1][$i2] = 0.0; for ($i3 = 0; $i3 < $N; $i3++) $xij[$i1][$i2] += $x[$i1][$i2][$i3]; $xij[$i1][$i2] /= $N; } } $xa = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) { for ($i3 = 0; $i3 < $N; $i3++) $xa += $x[$i1][$i2][$i3]; } } $xa /= ($Np[0] * $Np[1] * $N); $SP = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) $SP += ($xi[$i1] - $xa) * ($xi[$i1] - $xa); $SP *= ($Np[1] * $N); $SQ = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[1]; $i1++) $SQ += ($xj[$i1] - $xa) * ($xj[$i1] - $xa); $SQ *= ($Np[0] * $N); $SI = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) $SI += ($xij[$i1][$i2] - $xi[$i1] - $xj[$i2] + $xa) * ($xij[$i1][$i2] - $xi[$i1] - $xj[$i2] + $xa); } $SI *= $N; $SE = 0.0; for ($i1 = 0; $i1 < $Np[0]; $i1++) { for ($i2 = 0; $i2 < $Np[1]; $i2++) { for ($i3 = 0; $i3 < $N; $i3++) $SE += ($x[$i1][$i2][$i3] - $xij[$i1][$i2]) * ($x[$i1][$i2][$i3] - $xij[$i1][$i2]); } } $VP = $SP / ($Np[0] - 1); $VQ = $SQ / ($Np[1] - 1); $VI = $SI / (($Np[0] - 1) * ($Np[1] - 1)); $VE = $SE / ($Np[0] * $Np[1] * ($N - 1)); $FP = $VP / $VE; $FQ = $VQ / $VE; $FI = $VI / $VE; $p = 0.01 * $a; $dof2 = $Np[0] * $Np[1] * ($N - 1); printf("全変動: 平方和 %.2f 自由度 %d\n", $SP+$SQ+$SI+$SE, $Np[0]*$Np[1]*$N-1); $dof1 = $Np[0] - 1; printf("%sの水準間: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f F %.2f %d%値 %.2f\n", $name[0], $SP, $Np[0]-1, $VP, $FP, $a, p_f($sw)); $dof1 = $Np[1] - 1; printf("%sの水準間: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f F %.2f %d%値 %.2f\n", $name[1], $SQ, $Np[1]-1, $VQ, $FQ, $a, p_f($sw)); $dof1 = ($Np[0] - 1) * ($Np[1] - 1); printf("相互作用: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f F %.2f %d%値 %.2f\n", $SI, ($Np[0]-1)*($Np[1]-1), $VI, $FI, $a, p_f($sw)); printf("水準内: 平方和 %.2f 自由度 %d 不偏分散 %.4f\n", $SE, $Np[0]*$Np[1]*($N-1), $VE); } } /*********************************************************/ /* 二分法による非線形方程式(f(x)=0)の解 */ /* f : f(x)を計算する関数名 */ /* x1,x2 : 初期値 */ /* eps1 : 終了条件1(|x(k+1)-x(k)|<eps1) */ /* eps2 : 終了条件2(|f(x(k))|<eps2) */ /* max : 最大試行回数 */ /* ind : 実際の試行回数 */ /* (負の時は解を得ることができなかった) */ /* return : 解 */ /*********************************************************/ function bisection($f, $x1, $x2, $eps1, $eps2, $max, &$ind) { $x0 = 0.0; $f1 = $f($x1); $f2 = $f($x2); if ($f1*$f2 > 0.0) $ind = -1; else { $ind = 0; if ($f1*$f2 == 0.0) $x0 = ($f1 == 0.0) ? $x1 : $x2; else { $sw = 0; while ($sw == 0 && $ind >= 0) { $sw = 1; $ind += 1; $x0 = 0.5 * ($x1 + $x2); $f0 = $f($x0); if (abs($f0) > $eps2) { if ($ind <= $max) { if (abs($x1-$x2) > $eps1 && abs($x1-$x2) > $eps1*abs($x2)) { $sw = 0; if ($f0*$f1 < 0.0) { $x2 = $x0; $f2 = $f0; } else { $x1 = $x0; $f1 = $f0; } } } else $ind = -1; } } } } return $x0; } /*************************************************/ /* 標準正規分布N(0,1)の計算(P(X = x), P(X < x))*/ /* w : P(X = x) */ /* return : P(X < x) */ /*************************************************/ function normal($x, &$w) { $pi = 4.0 * atan(1.0); /* 確率密度関数(定義式) */ $w = exp(-0.5 * $x * $x) / sqrt(2.0 * $pi); /* 確率分布関数(近似式を使用) */ $y = 0.70710678118654 * abs($x); $z = 1.0 + $y * (0.0705230784 + $y * (0.0422820123 + $y * (0.0092705272 + $y * (0.0001520143 + $y * (0.0002765672 + $y * 0.0000430638))))); $P = 1.0 - pow($z, -16.0); if ($x < 0.0) $P = 0.5 - 0.5 * $P; else $P = 0.5 + 0.5 * $P; return $P; } /******************************************************************/ /* 標準正規分布N(0,1)のp%値(P(X > u) = 0.01p)(二分法を使用) */ /* ind : >= 0 : normal(収束回数) */ /* = -1 : 収束しなかった */ /******************************************************************/ function p_normal(&$ind) { $u = bisection("normal_f", -7.0, 7.0, 1.0e-6, 1.0e-10, 100, $sw); $ind = $sw; return $u; } /******************************/ /* 1.0 - p - P(X>x)(関数値) */ /******************************/ function normal_f($x) { global $p; return 1.0 - $p - normal($x, $y); } /*****************************************************/ /* Newton法による非線形方程式(f(x)=0)の解 */ /* f : f(x)を計算する関数名 */ /* df : f(x)の微分を計算する関数名 */ /* x0 : 初期値 */ /* eps1 : 終了条件1(|x(k+1)-x(k)|<eps1) */ /* eps2 : 終了条件2(|f(x(k))|<eps2) */ /* max : 最大試行回数 */ /* ind : 実際の試行回数 */ /* (負の時は解を得ることができなかった) */ /* return : 解 */ /*****************************************************/ function newton($f, $df, $x0, $eps1, $eps2, $max, &$ind) { $x1 = $x0; $x = $x1; $ind = 0; $sw = 0; while ($sw == 0 && $ind >= 0) { $sw = 1; $ind += 1; $g = $f($x1); if (abs($g) > $eps2) { if ($ind <= $max) { $dg = $df($x1); if (abs($dg) > $eps2) { $x = $x1 - $g / $dg; if (abs($x-$x1) > $eps1 && abs($x-$x1) > $eps1*abs($x)) { $x1 = $x; $sw = 0; } } else $ind = -1; } else $ind = -1; } } return $x; } /****************************************/ /* Γ(x)の計算(ガンマ関数,近似式) */ /* ier : =0 : normal */ /* =-1 : x=-n (n=0,1,2,・・・) */ /* return : 結果 */ /****************************************/ function gamma($x, &$ier) { $ier = 0; if ($x > 5.0) { $v = 1.0 / $x; $s = ((((((-0.000592166437354 * $v + 0.0000697281375837) * $v + 0.00078403922172) * $v - 0.000229472093621) * $v - 0.00268132716049) * $v + 0.00347222222222) * $v + 0.0833333333333) * $v + 1.0; $g = 2.506628274631001 * exp(-$x) * pow($x,$x-0.5) * $s; } else { $err = 1.0e-20; $w = $x; $t = 1.0; if ($x < 1.5) { if ($x < $err) { $k = intval($x); $y = floatval($k) - $x; if (abs($y) < $err || abs(1.0-$y) < $err) $ier = -1; } if ($ier == 0) { while ($w < 1.5) { $t /= $w; $w += 1.0; } } } else { if ($w > 2.5) { while ($w > 2.5) { $w -= 1.0; $t *= $w; } } } $w -= 2.0; $g = (((((((0.0021385778 * $w - 0.0034961289) * $w + 0.0122995771) * $w - 0.00012513767) * $w + 0.0740648982) * $w + 0.0815652323) * $w + 0.411849671) * $w + 0.422784604) * $w + 0.999999926; $g *= $t; } return $g; } /****************************************/ /* f分布の計算(P(X = ff), P(X < ff)) */ /* dd : P(X = ff) */ /* df1,df2 : 自由度 */ /* return : P(X < ff) */ /****************************************/ function f($ff, &$dd, $df1, $df2) { $pi = 4.0 * atan(1.0); if ($ff < 1.0e-10) $ff = 1.0e-10; $x = $ff * $df1 / ($ff * $df1 + $df2); if($df1%2 == 0) { if ($df2%2 == 0) { $u = $x * (1.0 - $x); $pp = $x; $ia = 2; $ib = 2; } else { $u = 0.5 * $x * sqrt(1.0-$x); $pp = 1.0 - sqrt(1.0-$x); $ia = 2; $ib = 1; } } else { if ($df2%2 == 0) { $u = 0.5 * sqrt($x) * (1.0 - $x); $pp = sqrt($x); $ia = 1; $ib = 2; } else { $u = sqrt($x*(1.0-$x)) / $pi; $pp = 1.0 - 2.0 * atan2(sqrt(1.0-$x), sqrt($x)) / $pi; $ia = 1; $ib = 1; } } if ($ia != $df1) { for ($i1 = $ia; $i1 <= $df1-2; $i1 += 2) { $pp -= 2.0 * $u / $i1; $u *= $x * ($i1 + $ib) / $i1; } } if ($ib != $df2) { for ($i1 = $ib; $i1 <= $df2-2; $i1 += 2) { $pp += 2.0 * $u / $i1; $u *= (1.0 - $x) * ($i1 + $df1) / $i1; } } $dd = $u / $ff; return $pp; } /****************************************/ /* f分布のp%値(P(X > u) = 0.01p) */ /* ind : >= 0 : normal(収束回数) */ /* = -1 : 収束しなかった */ /****************************************/ function p_f(&$ind) { global $p, $dof1, $dof2; $ff = 0.0; $sw = 0; $MAX = 340; /* 初期値計算の準備 while文は,大きな自由度によるガンマ関数の オーバーフローを避けるため */ while ($sw >= 0) { $df1 = 0.5 * ($dof1 - $sw); $df2 = 0.5 * $dof2; $a = 2.0 / (9.0 * ($dof1 - $sw)); $a1 = 1.0 - $a; $b = 2.0 / (9.0 * $dof2); $b1 = 1.0 - $b; $yq = p_normal($ind); $e = $b1 * $b1 - $b * $yq * $yq; if ($e > 0.8 || ($dof1+$dof2-$sw) <= $MAX) $sw = -1; else { $sw += 1; if (($dof1-$sw) == 0) $sw = -2; } } if ($sw == -2) $ind = -1; else { /* f0 : 初期値 */ if ($e > 0.8) { $x = ($a1 * $b1 + $yq * sqrt($a1*$a1*$b+$a*$e)) / $e; $f0 = pow($x, 3.0); } else { $y1 = pow(floatval($dof2), $df2-1.0); $y2 = pow(floatval($dof1), $df2); $x = gamma($df1+$df2, $ind) / gamma($df1, $ind) / gamma($df2, $ind) * 2.0 * $y1 / $y2 / $p; $f0 = pow($x, 2.0/$dof2); } /* ニュートン法 */ $ff = newton("f_f", "f_df", $f0, 1.0e-6, 1.0e-10, 100, $ind); } return $ff; } /********************************/ /* 1.0 - p - P(X > x)(関数値) */ /********************************/ function f_f($x) { global $p, $dof1, $dof2; return f($x, $y, $dof1, $dof2) - 1.0 + $p; } /**************************/ /* P(X = x)(関数の微分) */ /**************************/ function f_df($x) { global $dof1, $dof2; $z = f($x, $y, $dof1, $dof2); return $y; } /* -------- 一元配置法に対するデータ例(コメント部分を除いて下さい)-------- 1 6 5 // 因子の数 各水準におけるデータ数 有意水準(%) 工場 3 // 因子の名前 水準の数 3.1 4.7 5.1 // 各水準に対する1番目のデータ 4.1 5.6 3.7 // 各水準に対する2番目のデータ 3.3 4.3 4.5 // 各水準に対する3番目のデータ 3.9 5.9 6.0 // 各水準に対する4番目のデータ 3.7 6.1 3.9 // 各水準に対する5番目のデータ 2.4 4.2 5.4 // 各水準に対する6番目のデータ -------- 二元配置法に対するデータ例(コメント部分を除いて下さい)-------- 2 3 5 // 因子の数 各水準におけるデータ数 有意水準(%) 薬剤 5 // 1番目の因子の名前 その水準の数 品種 2 // 2番目の因子の名前 その水準の数 3 4 12 -4 -4 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準1に対する1番目のデータ 8 -8 31 12 19 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準1に対する2番目のデータ 7 -5 8 0 23 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準1に対する3番目のデータ 8 -10 9 10 15 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準2に対する1番目のデータ -5 11 26 -1 13 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準2に対する2番目のデータ 10 -6 13 -7 -6 // 1番目の因子の各水準に対して,2番目の因子の水準2に対する3番目のデータ */ ?>