/****************************/ /* クラスター分析 */ /* coded by Y.Suganuma */ /****************************/ import java.io.*; import java.util.StringTokenizer; public class Test { public static void main(String args[]) throws IOException { double x[][]; int i1, i2, k, k1, L, n, N, g[]; int method; StringTokenizer str; BufferedReader in = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in)); // 方法,グループ数,変数の数,及び,データの数 str = new StringTokenizer(in.readLine(), " "); method = Integer.parseInt(str.nextToken()); L = Integer.parseInt(str.nextToken()); n = Integer.parseInt(str.nextToken()); N = Integer.parseInt(str.nextToken()); g = new int [N]; x = new double [N][n]; // データ for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { str = new StringTokenizer(in.readLine(), " "); for (i2 = 0; i2 < n; i2++) x[i1][i2] = Double.parseDouble(str.nextToken()); } // クラスター分析 cluster(method, L, N, n, x, g); // 出力 k = 1; while (k <= L) { k1 = -1; System.out.println("グループ " + k); for (i1 = 0; i1 < N && k1 < 0; i1++) { if (g[i1] >= 0) k1 = g[i1]; } for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { if (g[i1] == k1) { System.out.print(" " + i1); for (i2 = 0; i2 < n; i2++) System.out.print(" " + x[i1][i2]); System.out.println(); g[i1] = -1; } } k++; } } /*********************************/ /* クラスター分析 */ /* method : =1 : 最短距離法 */ /* =2 : 最長距離法 */ /* =3 : メジアン法 */ /* =4 : 重心法 */ /* =5 : 群平均法 */ /* =6 : ウォード法 */ /* L : グループの数 */ /* N : データの数 */ /* n : 変量の数 */ /* x : データ */ /* g : 所属するグループ番号 */ /*********************************/ static void cluster(int method, int L, int N, int n, double x[][], int g[]) { double r[][], min; int ci = 0, cj = 0, i1, i2, k, M = N, n_g[]; // 初期設定 k = (method < 4) ? 0 : 1; n_g = new int [N]; r = new double [N][N]; for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { g[i1] = i1; n_g[i1] = 1; for (i2 = i1+1; i2 < N; i2++) r[i1][i2] = range(k, i1, i2, n, x); } for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { for (i2 = i1+1; i2 < N; i2++) r[i2][i1] = r[i1][i2]; } // 実行 while (M > L) { // 最小距離のクラスターを探す min = -1.0; for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { if (g[i1] == i1) { for (i2 = i1+1; i2 < N; i2++) { if (g[i2] == i2) { if (min < 0.0 || r[i1][i2] < min) { min = r[i1][i2]; ci = i1; cj = i2; } } } } } // クラスターを融合し,他のクラスターとの距離を計算 for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { if (g[i1] == i1) { for (i2 = i1+1; i2 < N; i2++) { if (g[i2] == i2) { if (i1 != cj && i2 != cj) { if (i1 == ci) { r[i1][i2] = range_c(method, r[ci][i2], r[cj][i2], r[ci][cj], n_g[ci], n_g[cj], n_g[i2]); r[i2][i1] = r[i1][i2]; } else if (i2 == ci) { r[i1][i2] = range_c(method, r[i1][ci], r[i1][cj], r[ci][cj], n_g[ci], n_g[cj], n_g[i2]); r[i2][i1] = r[i1][i2]; } } } } } } n_g[ci] += n_g[cj]; for (i1 = 0; i1 < N; i1++) { if (g[i1] == cj) g[i1] = ci; } M--; } } /*********************************************/ /* 2つのデータ間の距離 */ /* method : =0 : ユークリッド距離 */ /* =1 : ユークリッド距離の2乗 */ /* i,j : データ番号 */ /* n : 変量の数 */ /* x : データ */ /* return : 距離 */ /*********************************************/ static double range(int method, int i, int j, int n, double x[][]) { double x1, r = 0.0; int i2; for (i2 = 0; i2 < n; i2++) { x1 = x[i][i2] - x[j][i2]; r += x1 * x1; } if (method == 0) r = Math.sqrt(r); return r; } /***********************************************/ /* 2つのクラスター間の距離 */ /* method : =1 : 最短距離法 */ /* =2 : 最長距離法 */ /* =3 : メジアン法 */ /* =4 : 重心法 */ /* =5 : 群平均法 */ /* =6 : ウォード法 */ /* Dio : クラスターiとクラスターoとの距離 */ /* Djo : クラスターjとクラスターoとの距離 */ /* Dij : クラスターiとクラスターjとの距離 */ /* ni : クラスターiに含まれるデータ数 */ /* nj : クラスターjに含まれるデータ数 */ /* no : クラスターoに含まれるデータ数 */ /* x,y : データ */ /* return : 距離 */ /***********************************************/ static double range_c(int method, double Dio, double Djo, double Dij, int ni, int nj, int no) { double r = 0.0; int nk; switch (method) { // 最短距離法 case 1: r = (Dio <= Djo) ? Dio : Djo; break; // 最長距離法 case 2: r = (Dio >= Djo) ? Dio : Djo; break; // メジアン法 case 3: r = 0.5 * Dio + 0.5 * Djo - 0.25 * Dij; break; // 重心法 case 4: nk = ni + nj; r = ni * Dio / nk + nj * Djo / nk - (double)ni * nj * Dij / ((double)nk * nk); break; // 群平均法 case 5: nk = ni + nj; r = ni * Dio / nk + nj * Djo / nk; break; // ウォード法 case 6: nk = ni + nj; r = ((ni + no) * Dio + (nj + no) * Djo - no * Dij) / ((double)nk + no); break; } return r; } } ---------データ例(コメント部分を除いて下さい)--------- 1 3 2 100 // クラスター間距離を計算する方法(method),クラスタの数(L,クラスタの数がこの値になったら終了),変数の数(n),及び,データの数(N) 66.813742 25.509139 // x, y 50.813965 25.537399 74.048072 39.627578 14.792737 67.086620 42.838304 11.391394 32.301288 68.001189 24.436877 42.170217 60.451432 36.760112 24.314984 30.052427 55.573736 63.561140 72.162565 19.845151 43.217518 90.320780 51.888313 53.074269 28.150842 40.674284 31.619668 57.984410 64.360526 49.975656 53.702823 79.538952 45.052136 35.297650 4.702717 49.420025 92.649989 5.431771 65.403044 56.028507 48.797150 30.888271 40.806244 14.484027 84.355436 53.896156 50.133508 76.624964 49.405414 78.403179 76.824779 41.008448 63.246400 40.075843 78.538747 62.910356 64.396460 56.299403 77.152853 44.325319 80.592411 36.177862 48.763290 43.966714 58.789819 90.533976 13.684999 67.266671 75.163001 81.909246 46.451671 56.376068 65.105023 34.563928 45.815747 20.164535 33.227702 44.477025 41.061314 -54.334662 40.021202 -65.490282 22.829721 -56.861792 43.917033 -43.558827 40.723550 -43.188580 53.309317 -69.996428 31.463381 -31.506555 24.313168 -52.662580 17.433859 -57.468181 32.457761 -93.127719 9.183688 -31.686863 10.186332 -44.173216 27.925638 -62.236940 9.356182 -42.291381 23.036540 -27.153692 -16.261328 -35.185462 29.557288 -31.933335 36.519228 -59.269642 25.692837 -57.033021 22.797337 -52.169044 15.312205 -70.370841 22.086548 -25.219727 50.448475 -34.825824 30.814475 -40.968689 28.798789 -65.737936 59.822791 -25.673863 16.224354 -48.408079 6.867234 -61.804123 44.250439 -50.598095 54.117605 -20.539278 -43.244836 -3.374350 -19.122981 -9.026765 -4.632598 27.480272 26.647517 24.535738 19.527239 1.573533 -29.982384 26.884977 -11.856633 -24.568687 -9.244616 -3.343794 -15.656771 32.298241 -22.152364 24.203428 -34.526986 -27.862305 -60.500060 -18.400603 -6.902336 21.631805 -46.863390 -27.364383 -36.999128 4.181449 -24.599285 -17.177658 -24.814923 9.906257 -7.845930 9.388576 -36.128527 5.644606 -31.522759 11.282073 -12.500001 24.953627 -21.330455 -0.830663 -21.270652 -1.890803 -23.750951 5.435622 -25.563039 22.105947 -16.047432 -5.815069 -34.280972 30.657254 -36.264330 -8.759981 -12.109507 -15.804752 -33.227330 -5.857611